目前，我國企業(yè)出口商品主要有生產(chǎn)企業(yè)自營（委托）出口和通過外貿(mào)出口兩種方式，相應地，出口退稅形成了生產(chǎn)企業(yè)自營（委托）出口與外貿(mào)出口兩種不同的退稅方式。因為生產(chǎn)企業(yè)自營（委托）出口與外貿(mào)出口計算出口退稅有差異，導致二者稅負有較大區(qū)別，納稅人應結(jié)合自身情況，盡可能采用稅負低、出口退稅多的出口方式。
現(xiàn)行外貿(mào)企業(yè)出口貨物應退增值稅稅額，依進項稅額計算，具體計算公式為：應退稅額＝購進貨物的進項金額×退稅率；對出口貨物庫存賬和銷售賬均采用加權(quán)平均價核算的企業(yè)，應退稅額＝出口貨物數(shù)量×加權(quán)平均進價×退稅率，其退稅依據(jù)是外貿(mào)企業(yè)購進出口貨物的進價。而生產(chǎn)企業(yè)自營（委托）出口應退的增值稅是執(zhí)行“免、抵、退“”或“先征后退“”，出口退稅的稅額取決于出口的離岸價銷售收入及其進項稅額。
企業(yè)采用自營（委托）出口，自行辦理出口退稅的形式，同把貨物銷售給外貿(mào)企業(yè)出口，由外貿(mào)企業(yè)辦理出口退稅的形式稅負有何差異呢？這兩種形式因為在退稅方面采用不同的退稅方式，由此產(chǎn)生了不同的結(jié)果。
例如：某中外合資企業(yè)A公司以農(nóng)產(chǎn)品為原材料生產(chǎn)工業(yè)品出口，1999年自營出口20000萬元，可抵扣的進項稅額為1500萬元，該公司自營出口執(zhí)行先征后退，征稅率為17％，退稅率為13％，年應納增值稅額為：20000×17％－1500＝1900萬元，出口環(huán)節(jié)應退增值稅：20000×13％＝2600萬元。征稅機關可征增值稅1900萬元，退稅機關應退稅2600萬元，退稅扣減征稅后，該企業(yè)實際可得到的稅收補貼為700萬元。
假設A公司有關聯(lián)外貿(mào)B公司，A公司把產(chǎn)品以同樣的價格銷售給B公司，B公司再以同樣的價格銷售到境外，A公司開具增值稅專用發(fā)票價稅合計20000萬元，則A公司應納增值稅為：20000÷（1＋17％）×17％－1500＝1406萬元，B公司可得到退稅：20000÷（1＋17％）×13％＝2222萬元。
稅務機關征稅1406萬元，退稅機關退稅2
222萬元，A、B兩公司實際可得到的稅收補貼為2222－1406＝816萬元。
通過以上例子，我們不難發(fā)現(xiàn)，同樣的外銷收入，卻產(chǎn)生了不同的結(jié)果。從A、B兩公司來看，自營出口實際得到的稅收補貼是700萬元，而通過外貿(mào)出口實際得到的稅收補貼是816萬元，兩者相差達到116萬元。顯然，通過外貿(mào)出口對A、B公司更加劃算。
